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1. 定位不同，（公众号服务于营销与信息传递、小程序面向产品与服务）
小程序从功能上与公众号有严格的区分（不支持关注、消息推送等营销手段）
2. 技术区别：（公众号基于H5,小程序基于微信自身的开发环境与开发语言），小程序是微信内的云端应用（无需安装）底层技术实现了接近原生APP的体验，公众号是基于传统的H5开发与运行、而运行环境是浏览器，可以这样理解，公众号放的是一个网站，而小程序是一个APP。
（图片来自网络侵删）
3. 功能不同：（公众号围绕的是信息的展示与营销、小程序面向的是产品和服务）
4. 体验上的差异：（公众号操作延时较大、小程序体验接近原生APP）
二．小程序和APP的区别：
1. 小程序无需下载安装即可使用，用户的接受度更高，小程序的功能基本接近原生APP，却不会消耗手机的内存，而且，如果是安卓用户还可以将小程序添加到手机桌面，跟APP的展示一模一样。
2. 小程序可以直接通过附近搜索，而APP则不能，。
3. 功能层面：小程序不适合承载重需求，小程序只能作为一种小型实用工具，实用于那些使用频率低，功能相对少的应用，这点，小程序是不能和APP相比较的。
4. 小程序开发成本相对要低和开发时间要短。
5. 开放性比较：微信小程序是基于微信的应用，开发出来后只能在微信内可以使用，离开则不能使用，而APP更独立。
6. 在运营推广上：小程序要胜过APP，APP开发周期长，还要优秀的市场运营团队、推广成本越来越高、已至越来越难推广，而微信具备了国内优质的用户，这点小程序有较大的优势。
