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看它如何打破质谱数据分析僵局(分析数据僵局软件围观)

南宫静远 2024-07-23 21:09:53 0

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GitHub里面寻觅程序包

苦学Python、R语言,差点跨界做程序员

质谱数据虽好,但无从下手也是一大烦恼!

看它如何打破质谱数据分析僵局(分析数据僵局软件围观) 软件开发
(图片来自网络侵删)

偌大数据池,如何大海捞针,解锁暗藏玄机?

君不妨一试Progenesis

一款软件、两个维度、三种通路

四类模型、五大引擎、联网搜索、数据联动

全方位打造质谱立体化数据联邦!

P.S. 迫不及待想要了解Progenesis软件行业应用领域?

下拉文末立即报名沃特世专场讲座!

一款软件聚沙成塔 互联纵横

Progenesis是沃特世新一代LC-MS生物信息学产品,其利用独特算法和设计来处理和展示LC-MS数据,使科研人员能够对感兴趣的化合物和蛋白质进行精确定量分析和鉴定。
Progenesis支持所有主流仪器供应商的LC-MS数据格式,通过采用直观的导向性工作流程,使用户能够快速、客观且可靠地发现宝贵样品中的相关生物标记物。

图1.可支持多品牌数据导入

单机版及网络版两种部署方式足以应对信息时代的多样化需求,纵横各类网络。

两个维度大小通吃 一网打尽

Progenesis含有两个数据平台:

Progenesis QI:用于代谢组学/脂质组学研究Progenesis QI for proteomics:用于蛋白质组学研究

三种通路畅通无阻 数据可视

通路分析是组学数据分析的重要环节。
Progenesis QI提供了导出工具, 包含三种通路接口:IMPaLA、IPA、Metacore,可快速轻松地与第三方通路分析平台对接。

图2.一键链接通路分析

四类模型即刻建模 一目了然

Progenesis QI标准配备统计学工具,含有单变量分析、多元统计分析、相关分析和功效分析,可便捷找到感兴趣的化合物。
还可以通过与EZInfo 3.0的无缝集成来使用多元统计学模型,例如:偏最小二乘法/正交偏最小二乘法(PLS/OPLS)、偏最小二乘判别分析/正交偏最小二乘判别分析(PLS-DA/OPLS-DA)。

图3.内置多元统计学模型

五大引擎火眼金睛 快速鉴定

兼容NIST、METLIN MS/MS、Mascot Server三大商用数据库作为软件搜索引擎,同时标配ChemSpider、LipidBlast两大搜索引擎,联网联动,一键直达所需结果。

注:LipidBlast是Fiehn实验室于2013年上线的数据库,该数据库基于计算机预测的脂质类化合物的质谱信息来帮助研究者对脂质类化合物进行注释。

Progenesis QI推出新版本v3.0

该版本峰提取界面增加自定义编辑功能,允许查看后手动重新积分、删除、分割、合并和添加新的峰选择。
同时,新版本还增加了METLIN LC/MS/MS library 2019功能。

你以为这就结束了吗?

NO,你还有一个沃特世讲座邀请待接收!

沃特世将于近期推出两期网络讲座,专门分享Progenesis软件在不同领域的应用,欢迎感兴趣的你速来报名参加!
机会难得,不容错过哦!

讲座议程3月26日 周五 14:00-15:00

Progenesis软件在科研组学领域的应用

4月2日 周五 14:00-15:00

Progenesis 软件在食品、化工材料领域的应用

关注沃特世公众号报名

关于Progenesis

听听,正在使用的他们怎么说…

Michael Rützler | 隆德大学生物化学与结构生物学系

非靶向代谢组学分析是我在研究中会用到的分析方法之一,而且我最近才开始应用这种方法。
它要求分析人员具备多样化技能,才能获得有意义结果。

Progenesis软件将各种程序整合到一个简单的工作流程中,有效简化了我的研究工作。
同时,它能将所有中间步骤的结果清楚地可视化呈现,有助于我们掌控整个流程,这一点尤其令人满意。

Geert Goeminne| 比利时根特大学

对比需要600多个每次耗时30分钟的UPLC-HDMS样品分离,Progenesis QI在半天之内就能完成对齐和处理,我们从来没有想过能在这么短的时间内一次性处理如此大量的数据!

Progenesis QI已经成为我们处理代谢物谱图数据的标准软件,它大大加快了我们的处理速度,从对齐谱图到识别出存在显著变化的代谢物,我们的处理速度比以前至少快10倍!

Russell Pickford |生物分析及质谱研究中心

作为一个大型的质谱研究中心,我们需要执行各种定制化和常规的小分子分析。
目前我们正在越来越多地使用Progenesis QI分析项目中的代谢组学和脂类组学数据,这些项目数据涉及疾病代谢组学、基因敲除效应、海洋生物相互作用以及与体育运动相关的策划药等等。

易用性和强大的分析功能相结合,有助于我们快速培训新用户,让他们在项目中获取有用结果。
对检出化合物的确认一直以来都是代谢组学研究的难点,我们很高兴看到Progenesis QI正借助MS/MS数据解析和搜索功能解决这一难题。

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